В 1922 году святитель Вениамин и большая группа духовенства и верующих были привлечены к суду по ложному обвинению в сопротивлении изъятию церковных ценностей. В ночь с 12 на 13 августа 1922 года святитель Вениамин вместе с архимандритом Сергием (Шеиным), Юрием Новицким и Иваном Ковшаровым были преданы смерти. Все они ныне прославлены в лике святых мучеников.

На иконе Владыка Вениамин и арестованные вместе с ним представлены сидящими на скамье «подсудимых», но в древних иконах сидящим всегда изображался судья, таким образом, в конечном итоге судимые окажутся судящими. Вся сцена окружена стеной (обычный прием ограничения внутреннего пространства), за которой изображена печально знаменитая петроградская тюрьма — Кресты, где томились осужденные, купол главного кафедрального собора —Исаакиевского — и море, обозначающее прибрежное положение Петрограда.